GESTIÓN AMBIENTAL Esta línea tiene como objetivo desarrollar y caracterizar alternativas de administración uso y conservación de los recursos naturales haciendo énfasis en las tecnologías informáticas, cartográficas, de sensores remotos y en procesos experimentales en tiempo real.

COBIOR (Conservación de la Biodiversidad Regional) Esta línea pretende evaluar el potencial en oferta de especies y recursos de ecosistemas estratégicos, desarrollando inventarios, clasificando las especies, determinando la diversidad biológica de las áreas estudiadas y buscando alternativas tecnológicas para la utilización de esta diversidad de tal forma que se tenga un valor agregado para la región y el país.

GAMA (Geosistemas Andinos y Modelos de Antropización) Evalúa y determina las características ambientales de los ecosistemas altoandinos sus procesos de apropiación y transformación del paisaje generando información cartográfica de alta precisión y modelos de antropización que expliquen los procesos degradativos o de conservación por las comunidades que interactúan con estos ecosistemas.